El CDC fue creado el 06 de diciembre de 1989, mediante la suscripción de un convenio entre la Universidad de San Carlos de Guatemala y The Nature Conservancy (TNC). Forma parte de la red de CDC‘s establecida en 11 países de América Latina y el Caribe, 50 estados de los Estados Unidos y 4 provincias de Canadá. Su creación obedeció a la necesidad de contar con una unidad especializada en el tema de diversidad biológica para el acopio, organización, sistematización y accesibilidad de la información existente producida en el país por diversas instituciones, la cual estaba dispersa, con el fin de planificación, investigación y toma de decisiones.
En la actualidad funciona como una unidad técnico-científica del Centro de Estudios Conservacionistas. El CDC utiliza y basa sus operaciones en la metodología de Patrimonio Natural, sistema desarrollado y refinado por TNC, ABI y NatureServe. Correlaciona e integra información de especies, ecosistemas y áreas protegidas, por medio de bases de datos manuales y computarizadas, mapas y material bibliográfico. Actualmente la red de CDC‘s es coordinada por la organización internacional NatureServe:
http://www.natureserve.org